Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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PTPRJQ12913 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
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PTPRJQ12913 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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PTPRJQ12913 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC19■□□□□ 0.63
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