Protein–RNA interactions for Protein: Q12888

TP53BP1, TP53-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,972 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53BP1Q12888 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
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TP53BP1Q12888 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
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TP53BP1Q12888 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
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TP53BP1Q12888 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
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TP53BP1Q12888 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
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TP53BP1Q12888 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
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TP53BP1Q12888 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
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TP53BP1Q12888 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms