Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
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GTF3C1Q12789 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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GTF3C1Q12789 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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GTF3C1Q12789 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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GTF3C1Q12789 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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GTF3C1Q12789 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
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GTF3C1Q12789 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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GTF3C1Q12789 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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