Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms