Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SSRP1Q08945 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SSRP1Q08945 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SSRP1Q08945 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSRP1Q08945 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSRP1Q08945 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSRP1Q08945 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSRP1Q08945 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSRP1Q08945 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSRP1Q08945 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSRP1Q08945 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSRP1Q08945 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSRP1Q08945 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSRP1Q08945 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSRP1Q08945 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSRP1Q08945 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSRP1Q08945 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSRP1Q08945 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSRP1Q08945 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SSRP1Q08945 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSRP1Q08945 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSRP1Q08945 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSRP1Q08945 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SSRP1Q08945 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSRP1Q08945 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSRP1Q08945 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSRP1Q08945 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSRP1Q08945 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSRP1Q08945 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSRP1Q08945 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSRP1Q08945 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSRP1Q08945 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSRP1Q08945 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSRP1Q08945 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSRP1Q08945 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSRP1Q08945 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSRP1Q08945 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSRP1Q08945 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSRP1Q08945 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSRP1Q08945 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSRP1Q08945 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSRP1Q08945 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSRP1Q08945 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSRP1Q08945 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSRP1Q08945 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSRP1Q08945 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSRP1Q08945 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSRP1Q08945 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSRP1Q08945 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSRP1Q08945 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SSRP1Q08945 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSRP1Q08945 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSRP1Q08945 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSRP1Q08945 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms