Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms