Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms