Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 AC092801.1-201ENST00000443763 581 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms