Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms