Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP7AQ04656 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms