Protein–RNA interactions for Protein: Q04118

PRB3, Basic salivary proline-rich protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB3Q04118 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRB3Q04118 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PRB3Q04118 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PRB3Q04118 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
PRB3Q04118 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
PRB3Q04118 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PRB3Q04118 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PRB3Q04118 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PRB3Q04118 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PRB3Q04118 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PRB3Q04118 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PRB3Q04118 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRB3Q04118 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRB3Q04118 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRB3Q04118 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRB3Q04118 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRB3Q04118 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRB3Q04118 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRB3Q04118 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRB3Q04118 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRB3Q04118 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRB3Q04118 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRB3Q04118 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRB3Q04118 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRB3Q04118 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRB3Q04118 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRB3Q04118 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRB3Q04118 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRB3Q04118 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRB3Q04118 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRB3Q04118 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PRB3Q04118 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRB3Q04118 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRB3Q04118 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRB3Q04118 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRB3Q04118 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRB3Q04118 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRB3Q04118 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRB3Q04118 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRB3Q04118 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRB3Q04118 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRB3Q04118 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRB3Q04118 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRB3Q04118 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRB3Q04118 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRB3Q04118 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PRB3Q04118 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRB3Q04118 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRB3Q04118 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRB3Q04118 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRB3Q04118 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRB3Q04118 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRB3Q04118 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRB3Q04118 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRB3Q04118 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRB3Q04118 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRB3Q04118 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRB3Q04118 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRB3Q04118 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRB3Q04118 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRB3Q04118 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRB3Q04118 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRB3Q04118 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRB3Q04118 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRB3Q04118 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRB3Q04118 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRB3Q04118 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRB3Q04118 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRB3Q04118 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRB3Q04118 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRB3Q04118 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRB3Q04118 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRB3Q04118 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRB3Q04118 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRB3Q04118 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PRB3Q04118 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRB3Q04118 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PRB3Q04118 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRB3Q04118 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PRB3Q04118 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRB3Q04118 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRB3Q04118 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRB3Q04118 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRB3Q04118 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PRB3Q04118 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRB3Q04118 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRB3Q04118 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRB3Q04118 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRB3Q04118 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRB3Q04118 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRB3Q04118 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRB3Q04118 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRB3Q04118 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRB3Q04118 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRB3Q04118 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRB3Q04118 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRB3Q04118 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRB3Q04118 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRB3Q04118 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRB3Q04118 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms