Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms