Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms