Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms