Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms