Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRB1P82279 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRB1P82279 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRB1P82279 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CRB1P82279 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRB1P82279 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRB1P82279 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CRB1P82279 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRB1P82279 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRB1P82279 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRB1P82279 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRB1P82279 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRB1P82279 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CRB1P82279 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRB1P82279 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRB1P82279 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRB1P82279 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRB1P82279 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRB1P82279 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRB1P82279 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRB1P82279 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRB1P82279 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRB1P82279 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRB1P82279 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRB1P82279 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRB1P82279 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRB1P82279 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRB1P82279 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CRB1P82279 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRB1P82279 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRB1P82279 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRB1P82279 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRB1P82279 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRB1P82279 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRB1P82279 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRB1P82279 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRB1P82279 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRB1P82279 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRB1P82279 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRB1P82279 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRB1P82279 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRB1P82279 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRB1P82279 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRB1P82279 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRB1P82279 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRB1P82279 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRB1P82279 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRB1P82279 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CRB1P82279 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CRB1P82279 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CRB1P82279 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
CRB1P82279 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CRB1P82279 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CRB1P82279 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
CRB1P82279 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
CRB1P82279 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CRB1P82279 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CRB1P82279 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRB1P82279 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRB1P82279 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRB1P82279 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRB1P82279 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRB1P82279 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRB1P82279 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRB1P82279 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CRB1P82279 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRB1P82279 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRB1P82279 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRB1P82279 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRB1P82279 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRB1P82279 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRB1P82279 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRB1P82279 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRB1P82279 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRB1P82279 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CRB1P82279 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRB1P82279 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRB1P82279 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRB1P82279 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRB1P82279 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRB1P82279 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRB1P82279 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRB1P82279 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CRB1P82279 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRB1P82279 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRB1P82279 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRB1P82279 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CRB1P82279 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CRB1P82279 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CRB1P82279 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CRB1P82279 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CRB1P82279 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRB1P82279 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRB1P82279 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRB1P82279 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRB1P82279 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRB1P82279 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRB1P82279 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRB1P82279 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRB1P82279 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101 ms