Protein–RNA interactions for Protein: P78406

RAE1, mRNA export factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAE1P78406 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAE1P78406 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAE1P78406 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAE1P78406 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAE1P78406 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAE1P78406 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAE1P78406 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAE1P78406 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAE1P78406 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAE1P78406 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAE1P78406 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAE1P78406 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAE1P78406 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAE1P78406 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RAE1P78406 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RAE1P78406 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RAE1P78406 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAE1P78406 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAE1P78406 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAE1P78406 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAE1P78406 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAE1P78406 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAE1P78406 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAE1P78406 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAE1P78406 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAE1P78406 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAE1P78406 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAE1P78406 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAE1P78406 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAE1P78406 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAE1P78406 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAE1P78406 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAE1P78406 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAE1P78406 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAE1P78406 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAE1P78406 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RAE1P78406 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAE1P78406 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAE1P78406 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAE1P78406 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RAE1P78406 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAE1P78406 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAE1P78406 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RAE1P78406 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RAE1P78406 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAE1P78406 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAE1P78406 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAE1P78406 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAE1P78406 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAE1P78406 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAE1P78406 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAE1P78406 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAE1P78406 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAE1P78406 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAE1P78406 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAE1P78406 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAE1P78406 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAE1P78406 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAE1P78406 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RAE1P78406 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAE1P78406 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAE1P78406 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAE1P78406 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAE1P78406 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAE1P78406 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAE1P78406 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAE1P78406 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAE1P78406 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAE1P78406 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAE1P78406 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAE1P78406 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAE1P78406 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAE1P78406 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RAE1P78406 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RAE1P78406 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAE1P78406 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAE1P78406 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAE1P78406 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAE1P78406 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAE1P78406 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAE1P78406 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAE1P78406 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAE1P78406 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAE1P78406 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAE1P78406 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAE1P78406 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RAE1P78406 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAE1P78406 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAE1P78406 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAE1P78406 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAE1P78406 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAE1P78406 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAE1P78406 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RAE1P78406 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAE1P78406 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAE1P78406 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAE1P78406 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAE1P78406 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAE1P78406 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAE1P78406 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms