Protein–RNA interactions for Protein: P62701

RPS4X, 40S ribosomal protein S4, X isoform, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS4XP62701 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPS4XP62701 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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