Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VBP1P61758 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VBP1P61758 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VBP1P61758 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VBP1P61758 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VBP1P61758 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VBP1P61758 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VBP1P61758 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VBP1P61758 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VBP1P61758 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VBP1P61758 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VBP1P61758 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VBP1P61758 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VBP1P61758 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VBP1P61758 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VBP1P61758 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VBP1P61758 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VBP1P61758 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VBP1P61758 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VBP1P61758 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VBP1P61758 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VBP1P61758 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
VBP1P61758 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VBP1P61758 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VBP1P61758 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VBP1P61758 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VBP1P61758 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VBP1P61758 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VBP1P61758 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VBP1P61758 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VBP1P61758 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
VBP1P61758 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VBP1P61758 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
VBP1P61758 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VBP1P61758 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VBP1P61758 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VBP1P61758 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VBP1P61758 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VBP1P61758 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VBP1P61758 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VBP1P61758 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
VBP1P61758 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VBP1P61758 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VBP1P61758 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VBP1P61758 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VBP1P61758 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VBP1P61758 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VBP1P61758 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VBP1P61758 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VBP1P61758 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VBP1P61758 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VBP1P61758 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VBP1P61758 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VBP1P61758 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VBP1P61758 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VBP1P61758 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VBP1P61758 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VBP1P61758 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VBP1P61758 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VBP1P61758 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VBP1P61758 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VBP1P61758 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VBP1P61758 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VBP1P61758 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VBP1P61758 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VBP1P61758 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VBP1P61758 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VBP1P61758 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VBP1P61758 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VBP1P61758 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VBP1P61758 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VBP1P61758 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VBP1P61758 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VBP1P61758 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VBP1P61758 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VBP1P61758 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VBP1P61758 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VBP1P61758 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VBP1P61758 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VBP1P61758 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VBP1P61758 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VBP1P61758 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VBP1P61758 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VBP1P61758 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VBP1P61758 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VBP1P61758 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VBP1P61758 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VBP1P61758 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VBP1P61758 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VBP1P61758 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VBP1P61758 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VBP1P61758 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VBP1P61758 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VBP1P61758 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VBP1P61758 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VBP1P61758 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VBP1P61758 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VBP1P61758 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VBP1P61758 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VBP1P61758 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms