Protein–RNA interactions for Protein: P59037

LINC00313, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00313, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00313P59037 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms