Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FAM3BP58499 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FAM3BP58499 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FAM3BP58499 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FAM3BP58499 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FAM3BP58499 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FAM3BP58499 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FAM3BP58499 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FAM3BP58499 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
FAM3BP58499 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FAM3BP58499 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FAM3BP58499 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FAM3BP58499 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
FAM3BP58499 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FAM3BP58499 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FAM3BP58499 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FAM3BP58499 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FAM3BP58499 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FAM3BP58499 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FAM3BP58499 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FAM3BP58499 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FAM3BP58499 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FAM3BP58499 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FAM3BP58499 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FAM3BP58499 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FAM3BP58499 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FAM3BP58499 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FAM3BP58499 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FAM3BP58499 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FAM3BP58499 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FAM3BP58499 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FAM3BP58499 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FAM3BP58499 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FAM3BP58499 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FAM3BP58499 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FAM3BP58499 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FAM3BP58499 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FAM3BP58499 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FAM3BP58499 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FAM3BP58499 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FAM3BP58499 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FAM3BP58499 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
FAM3BP58499 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FAM3BP58499 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FAM3BP58499 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FAM3BP58499 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FAM3BP58499 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FAM3BP58499 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FAM3BP58499 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FAM3BP58499 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FAM3BP58499 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FAM3BP58499 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FAM3BP58499 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FAM3BP58499 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FAM3BP58499 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FAM3BP58499 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FAM3BP58499 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FAM3BP58499 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FAM3BP58499 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms