Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME5P56597 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME5P56597 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME5P56597 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME5P56597 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME5P56597 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME5P56597 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME5P56597 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NME5P56597 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME5P56597 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NME5P56597 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME5P56597 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME5P56597 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME5P56597 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME5P56597 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME5P56597 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME5P56597 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME5P56597 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME5P56597 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME5P56597 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME5P56597 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME5P56597 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME5P56597 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME5P56597 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME5P56597 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME5P56597 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME5P56597 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME5P56597 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME5P56597 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME5P56597 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME5P56597 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME5P56597 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME5P56597 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME5P56597 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NME5P56597 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NME5P56597 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NME5P56597 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NME5P56597 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NME5P56597 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NME5P56597 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NME5P56597 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NME5P56597 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NME5P56597 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NME5P56597 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NME5P56597 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NME5P56597 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NME5P56597 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NME5P56597 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NME5P56597 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NME5P56597 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NME5P56597 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NME5P56597 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NME5P56597 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NME5P56597 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NME5P56597 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NME5P56597 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NME5P56597 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NME5P56597 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NME5P56597 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NME5P56597 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NME5P56597 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NME5P56597 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NME5P56597 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NME5P56597 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NME5P56597 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NME5P56597 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NME5P56597 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NME5P56597 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NME5P56597 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NME5P56597 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NME5P56597 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NME5P56597 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NME5P56597 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NME5P56597 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NME5P56597 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NME5P56597 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NME5P56597 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NME5P56597 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NME5P56597 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NME5P56597 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NME5P56597 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NME5P56597 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NME5P56597 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NME5P56597 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NME5P56597 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NME5P56597 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NME5P56597 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NME5P56597 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NME5P56597 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NME5P56597 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NME5P56597 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NME5P56597 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NME5P56597 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NME5P56597 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NME5P56597 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NME5P56597 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NME5P56597 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NME5P56597 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NME5P56597 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NME5P56597 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms