Protein–RNA interactions for Protein: P55895

RAG2, V(D)J recombination-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG2P55895 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAG2P55895 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAG2P55895 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAG2P55895 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAG2P55895 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAG2P55895 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAG2P55895 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAG2P55895 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAG2P55895 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAG2P55895 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAG2P55895 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAG2P55895 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAG2P55895 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAG2P55895 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAG2P55895 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAG2P55895 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAG2P55895 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAG2P55895 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAG2P55895 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAG2P55895 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAG2P55895 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAG2P55895 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAG2P55895 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAG2P55895 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAG2P55895 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAG2P55895 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAG2P55895 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAG2P55895 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAG2P55895 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAG2P55895 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAG2P55895 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAG2P55895 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAG2P55895 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAG2P55895 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAG2P55895 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAG2P55895 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAG2P55895 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAG2P55895 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAG2P55895 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAG2P55895 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAG2P55895 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAG2P55895 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAG2P55895 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAG2P55895 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAG2P55895 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAG2P55895 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAG2P55895 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAG2P55895 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAG2P55895 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAG2P55895 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAG2P55895 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAG2P55895 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAG2P55895 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAG2P55895 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAG2P55895 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAG2P55895 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAG2P55895 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAG2P55895 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAG2P55895 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAG2P55895 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAG2P55895 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAG2P55895 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAG2P55895 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAG2P55895 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAG2P55895 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAG2P55895 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAG2P55895 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAG2P55895 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAG2P55895 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAG2P55895 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAG2P55895 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAG2P55895 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAG2P55895 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAG2P55895 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAG2P55895 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAG2P55895 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAG2P55895 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAG2P55895 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAG2P55895 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAG2P55895 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAG2P55895 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAG2P55895 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAG2P55895 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAG2P55895 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAG2P55895 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAG2P55895 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAG2P55895 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAG2P55895 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAG2P55895 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAG2P55895 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAG2P55895 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAG2P55895 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAG2P55895 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAG2P55895 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAG2P55895 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAG2P55895 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAG2P55895 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAG2P55895 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAG2P55895 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAG2P55895 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms