Protein–RNA interactions for Protein: P53007

SLC25A1, Tricarboxylate transport protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A1P53007 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLC25A1P53007 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLC25A1P53007 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLC25A1P53007 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLC25A1P53007 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLC25A1P53007 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLC25A1P53007 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC25A1P53007 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC25A1P53007 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC25A1P53007 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC25A1P53007 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC25A1P53007 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC25A1P53007 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC25A1P53007 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC25A1P53007 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC25A1P53007 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC25A1P53007 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC25A1P53007 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC25A1P53007 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC25A1P53007 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC25A1P53007 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC25A1P53007 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC25A1P53007 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms