Protein–RNA interactions for Protein: P49368

CCT3, T-complex protein 1 subunit gamma, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT3P49368 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCT3P49368 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCT3P49368 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCT3P49368 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCT3P49368 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCT3P49368 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCT3P49368 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCT3P49368 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCT3P49368 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCT3P49368 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCT3P49368 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCT3P49368 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCT3P49368 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCT3P49368 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCT3P49368 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCT3P49368 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCT3P49368 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCT3P49368 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCT3P49368 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCT3P49368 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCT3P49368 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCT3P49368 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCT3P49368 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCT3P49368 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCT3P49368 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCT3P49368 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCT3P49368 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCT3P49368 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCT3P49368 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCT3P49368 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCT3P49368 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCT3P49368 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCT3P49368 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCT3P49368 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCT3P49368 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCT3P49368 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCT3P49368 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCT3P49368 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCT3P49368 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCT3P49368 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCT3P49368 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCT3P49368 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCT3P49368 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCT3P49368 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCT3P49368 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCT3P49368 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCT3P49368 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCT3P49368 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCT3P49368 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCT3P49368 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCT3P49368 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCT3P49368 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCT3P49368 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCT3P49368 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCT3P49368 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCT3P49368 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCT3P49368 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCT3P49368 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCT3P49368 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCT3P49368 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCT3P49368 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCT3P49368 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCT3P49368 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCT3P49368 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCT3P49368 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCT3P49368 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCT3P49368 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCT3P49368 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCT3P49368 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCT3P49368 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCT3P49368 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCT3P49368 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCT3P49368 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCT3P49368 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCT3P49368 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCT3P49368 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCT3P49368 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCT3P49368 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCT3P49368 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCT3P49368 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCT3P49368 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCT3P49368 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCT3P49368 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCT3P49368 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCT3P49368 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCT3P49368 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCT3P49368 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCT3P49368 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCT3P49368 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCT3P49368 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCT3P49368 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCT3P49368 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCT3P49368 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCT3P49368 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCT3P49368 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCT3P49368 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCT3P49368 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCT3P49368 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCT3P49368 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCT3P49368 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms