Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNTAP49354 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNTAP49354 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNTAP49354 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNTAP49354 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNTAP49354 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNTAP49354 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNTAP49354 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNTAP49354 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNTAP49354 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNTAP49354 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNTAP49354 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNTAP49354 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNTAP49354 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNTAP49354 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNTAP49354 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNTAP49354 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FNTAP49354 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNTAP49354 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FNTAP49354 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FNTAP49354 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FNTAP49354 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FNTAP49354 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FNTAP49354 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FNTAP49354 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FNTAP49354 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FNTAP49354 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FNTAP49354 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FNTAP49354 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FNTAP49354 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FNTAP49354 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
FNTAP49354 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FNTAP49354 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FNTAP49354 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FNTAP49354 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
FNTAP49354 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FNTAP49354 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FNTAP49354 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FNTAP49354 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FNTAP49354 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FNTAP49354 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FNTAP49354 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FNTAP49354 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FNTAP49354 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FNTAP49354 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FNTAP49354 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FNTAP49354 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FNTAP49354 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FNTAP49354 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FNTAP49354 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FNTAP49354 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FNTAP49354 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
FNTAP49354 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FNTAP49354 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FNTAP49354 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FNTAP49354 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FNTAP49354 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FNTAP49354 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FNTAP49354 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FNTAP49354 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FNTAP49354 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FNTAP49354 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FNTAP49354 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FNTAP49354 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FNTAP49354 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FNTAP49354 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FNTAP49354 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FNTAP49354 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FNTAP49354 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FNTAP49354 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FNTAP49354 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FNTAP49354 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FNTAP49354 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FNTAP49354 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FNTAP49354 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FNTAP49354 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FNTAP49354 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
FNTAP49354 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
FNTAP49354 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FNTAP49354 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FNTAP49354 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FNTAP49354 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FNTAP49354 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FNTAP49354 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FNTAP49354 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FNTAP49354 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FNTAP49354 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FNTAP49354 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FNTAP49354 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
FNTAP49354 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FNTAP49354 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FNTAP49354 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FNTAP49354 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FNTAP49354 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FNTAP49354 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FNTAP49354 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FNTAP49354 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FNTAP49354 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FNTAP49354 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
FNTAP49354 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms