Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATRXP46100 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATRXP46100 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATRXP46100 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATRXP46100 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRXP46100 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRXP46100 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRXP46100 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRXP46100 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRXP46100 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRXP46100 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRXP46100 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRXP46100 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRXP46100 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRXP46100 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRXP46100 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRXP46100 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRXP46100 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRXP46100 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRXP46100 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRXP46100 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRXP46100 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRXP46100 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRXP46100 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRXP46100 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRXP46100 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRXP46100 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRXP46100 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRXP46100 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRXP46100 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRXP46100 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRXP46100 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRXP46100 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRXP46100 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRXP46100 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRXP46100 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRXP46100 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRXP46100 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRXP46100 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRXP46100 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRXP46100 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRXP46100 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATRXP46100 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATRXP46100 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATRXP46100 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATRXP46100 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATRXP46100 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATRXP46100 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATRXP46100 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATRXP46100 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATRXP46100 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATRXP46100 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATRXP46100 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATRXP46100 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATRXP46100 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATRXP46100 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATRXP46100 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATRXP46100 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATRXP46100 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATRXP46100 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATRXP46100 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATRXP46100 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATRXP46100 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATRXP46100 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATRXP46100 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATRXP46100 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATRXP46100 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATRXP46100 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATRXP46100 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATRXP46100 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATRXP46100 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATRXP46100 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATRXP46100 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATRXP46100 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATRXP46100 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATRXP46100 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATRXP46100 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATRXP46100 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATRXP46100 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATRXP46100 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATRXP46100 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATRXP46100 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATRXP46100 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATRXP46100 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATRXP46100 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATRXP46100 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATRXP46100 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATRXP46100 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATRXP46100 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATRXP46100 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATRXP46100 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATRXP46100 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATRXP46100 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATRXP46100 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATRXP46100 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATRXP46100 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATRXP46100 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATRXP46100 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATRXP46100 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATRXP46100 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms