Protein–RNA interactions for Protein: P41217

CD200, OX-2 membrane glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD200P41217 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD200P41217 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD200P41217 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD200P41217 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD200P41217 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD200P41217 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD200P41217 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD200P41217 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD200P41217 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD200P41217 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD200P41217 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD200P41217 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD200P41217 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD200P41217 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD200P41217 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD200P41217 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CD200P41217 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD200P41217 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD200P41217 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD200P41217 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD200P41217 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD200P41217 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD200P41217 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD200P41217 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD200P41217 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD200P41217 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD200P41217 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD200P41217 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD200P41217 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD200P41217 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD200P41217 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD200P41217 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD200P41217 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD200P41217 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD200P41217 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD200P41217 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD200P41217 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD200P41217 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD200P41217 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD200P41217 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD200P41217 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD200P41217 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD200P41217 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD200P41217 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD200P41217 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD200P41217 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD200P41217 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD200P41217 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD200P41217 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD200P41217 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD200P41217 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD200P41217 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CD200P41217 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD200P41217 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD200P41217 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD200P41217 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD200P41217 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD200P41217 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD200P41217 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD200P41217 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD200P41217 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD200P41217 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD200P41217 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD200P41217 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD200P41217 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD200P41217 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD200P41217 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD200P41217 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CD200P41217 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD200P41217 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD200P41217 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD200P41217 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD200P41217 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD200P41217 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD200P41217 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD200P41217 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD200P41217 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD200P41217 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD200P41217 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD200P41217 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD200P41217 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD200P41217 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD200P41217 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD200P41217 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD200P41217 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD200P41217 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD200P41217 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CD200P41217 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CD200P41217 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD200P41217 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CD200P41217 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD200P41217 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD200P41217 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CD200P41217 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD200P41217 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD200P41217 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD200P41217 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD200P41217 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD200P41217 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD200P41217 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms