Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms