Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6V1E1P36543 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms