Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJC1P36383 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJC1P36383 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJC1P36383 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJC1P36383 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJC1P36383 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJC1P36383 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJC1P36383 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
GJC1P36383 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.58
GJC1P36383 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJC1P36383 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJC1P36383 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJC1P36383 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJC1P36383 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJC1P36383 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GJC1P36383 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJC1P36383 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJC1P36383 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJC1P36383 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJC1P36383 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJC1P36383 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJC1P36383 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJC1P36383 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJC1P36383 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJC1P36383 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJC1P36383 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJC1P36383 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GJC1P36383 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJC1P36383 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJC1P36383 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJC1P36383 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJC1P36383 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJC1P36383 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJC1P36383 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJC1P36383 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJC1P36383 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJC1P36383 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJC1P36383 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJC1P36383 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJC1P36383 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJC1P36383 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJC1P36383 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJC1P36383 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJC1P36383 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJC1P36383 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJC1P36383 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJC1P36383 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJC1P36383 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJC1P36383 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJC1P36383 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJC1P36383 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJC1P36383 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJC1P36383 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJC1P36383 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJC1P36383 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJC1P36383 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJC1P36383 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJC1P36383 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJC1P36383 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJC1P36383 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GJC1P36383 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJC1P36383 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GJC1P36383 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GJC1P36383 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJC1P36383 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GJC1P36383 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJC1P36383 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJC1P36383 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJC1P36383 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJC1P36383 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJC1P36383 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJC1P36383 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJC1P36383 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJC1P36383 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJC1P36383 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GJC1P36383 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJC1P36383 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJC1P36383 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GJC1P36383 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJC1P36383 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJC1P36383 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJC1P36383 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJC1P36383 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJC1P36383 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJC1P36383 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJC1P36383 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJC1P36383 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJC1P36383 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJC1P36383 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJC1P36383 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJC1P36383 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJC1P36383 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJC1P36383 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJC1P36383 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJC1P36383 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJC1P36383 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GJC1P36383 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJC1P36383 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GJC1P36383 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJC1P36383 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms