Protein–RNA interactions for Protein: P35658

NUP214, Nuclear pore complex protein Nup214, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP214P35658 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP214P35658 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP214P35658 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP214P35658 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP214P35658 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP214P35658 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP214P35658 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP214P35658 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP214P35658 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP214P35658 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP214P35658 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP214P35658 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP214P35658 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP214P35658 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP214P35658 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP214P35658 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP214P35658 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP214P35658 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP214P35658 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP214P35658 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP214P35658 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP214P35658 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP214P35658 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP214P35658 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP214P35658 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP214P35658 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP214P35658 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP214P35658 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP214P35658 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP214P35658 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP214P35658 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP214P35658 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP214P35658 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP214P35658 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP214P35658 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP214P35658 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP214P35658 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP214P35658 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP214P35658 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP214P35658 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP214P35658 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP214P35658 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP214P35658 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP214P35658 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP214P35658 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP214P35658 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP214P35658 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP214P35658 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP214P35658 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP214P35658 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP214P35658 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP214P35658 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP214P35658 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP214P35658 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP214P35658 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP214P35658 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP214P35658 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP214P35658 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
NUP214P35658 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
NUP214P35658 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
NUP214P35658 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP214P35658 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP214P35658 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP214P35658 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP214P35658 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP214P35658 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP214P35658 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP214P35658 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP214P35658 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP214P35658 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP214P35658 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP214P35658 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP214P35658 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP214P35658 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP214P35658 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP214P35658 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP214P35658 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP214P35658 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP214P35658 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP214P35658 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP214P35658 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP214P35658 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP214P35658 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP214P35658 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP214P35658 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP214P35658 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP214P35658 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP214P35658 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP214P35658 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP214P35658 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP214P35658 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP214P35658 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP214P35658 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP214P35658 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP214P35658 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP214P35658 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP214P35658 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP214P35658 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP214P35658 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP214P35658 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms