Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD12P35452 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms