Protein–RNA interactions for Protein: P34925

RYK, Tyrosine-protein kinase RYK, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYKP34925 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RYKP34925 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RYKP34925 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RYKP34925 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RYKP34925 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RYKP34925 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RYKP34925 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RYKP34925 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RYKP34925 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RYKP34925 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RYKP34925 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RYKP34925 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RYKP34925 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RYKP34925 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RYKP34925 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RYKP34925 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RYKP34925 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RYKP34925 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RYKP34925 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RYKP34925 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RYKP34925 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RYKP34925 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RYKP34925 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RYKP34925 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RYKP34925 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RYKP34925 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RYKP34925 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RYKP34925 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RYKP34925 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RYKP34925 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RYKP34925 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RYKP34925 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RYKP34925 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RYKP34925 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RYKP34925 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RYKP34925 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RYKP34925 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RYKP34925 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RYKP34925 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RYKP34925 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RYKP34925 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RYKP34925 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RYKP34925 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RYKP34925 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RYKP34925 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RYKP34925 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RYKP34925 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RYKP34925 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RYKP34925 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RYKP34925 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RYKP34925 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RYKP34925 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RYKP34925 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RYKP34925 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RYKP34925 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RYKP34925 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RYKP34925 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RYKP34925 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RYKP34925 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RYKP34925 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RYKP34925 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RYKP34925 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RYKP34925 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RYKP34925 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RYKP34925 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RYKP34925 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RYKP34925 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RYKP34925 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RYKP34925 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RYKP34925 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RYKP34925 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RYKP34925 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RYKP34925 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RYKP34925 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RYKP34925 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RYKP34925 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RYKP34925 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RYKP34925 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RYKP34925 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RYKP34925 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RYKP34925 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RYKP34925 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RYKP34925 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RYKP34925 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RYKP34925 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RYKP34925 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RYKP34925 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RYKP34925 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RYKP34925 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RYKP34925 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RYKP34925 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RYKP34925 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RYKP34925 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RYKP34925 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RYKP34925 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RYKP34925 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RYKP34925 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RYKP34925 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RYKP34925 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RYKP34925 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms