Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCKARP32238 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCKARP32238 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCKARP32238 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCKARP32238 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCKARP32238 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCKARP32238 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCKARP32238 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCKARP32238 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCKARP32238 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKARP32238 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKARP32238 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKARP32238 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKARP32238 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKARP32238 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKARP32238 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKARP32238 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKARP32238 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKARP32238 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKARP32238 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKARP32238 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKARP32238 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKARP32238 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKARP32238 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKARP32238 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKARP32238 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKARP32238 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKARP32238 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKARP32238 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKARP32238 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKARP32238 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKARP32238 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKARP32238 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKARP32238 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKARP32238 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKARP32238 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKARP32238 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKARP32238 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKARP32238 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKARP32238 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKARP32238 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKARP32238 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKARP32238 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKARP32238 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKARP32238 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKARP32238 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKARP32238 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKARP32238 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKARP32238 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKARP32238 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKARP32238 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCKARP32238 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCKARP32238 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCKARP32238 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCKARP32238 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCKARP32238 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCKARP32238 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCKARP32238 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCKARP32238 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCKARP32238 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCKARP32238 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCKARP32238 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCKARP32238 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCKARP32238 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCKARP32238 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCKARP32238 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCKARP32238 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCKARP32238 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCKARP32238 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCKARP32238 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCKARP32238 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCKARP32238 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCKARP32238 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCKARP32238 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCKARP32238 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCKARP32238 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCKARP32238 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCKARP32238 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCKARP32238 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCKARP32238 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCKARP32238 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCKARP32238 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCKARP32238 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKARP32238 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKARP32238 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKARP32238 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKARP32238 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKARP32238 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKARP32238 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKARP32238 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKARP32238 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKARP32238 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKARP32238 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKARP32238 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKARP32238 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKARP32238 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKARP32238 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKARP32238 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKARP32238 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKARP32238 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms