Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
HOXA7P31268 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA7P31268 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms