Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNNA2P26232 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNNA2P26232 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNNA2P26232 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNNA2P26232 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNNA2P26232 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNA2P26232 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNA2P26232 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNA2P26232 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNA2P26232 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNA2P26232 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNA2P26232 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNA2P26232 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNA2P26232 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNA2P26232 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNA2P26232 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNA2P26232 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNA2P26232 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNA2P26232 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNA2P26232 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNA2P26232 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNA2P26232 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNA2P26232 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNA2P26232 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNA2P26232 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNA2P26232 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNA2P26232 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNA2P26232 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNA2P26232 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNA2P26232 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNA2P26232 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNA2P26232 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNA2P26232 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNA2P26232 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNA2P26232 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNNA2P26232 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNNA2P26232 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNNA2P26232 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNNA2P26232 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNNA2P26232 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNNA2P26232 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNNA2P26232 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNNA2P26232 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNNA2P26232 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNNA2P26232 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNNA2P26232 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNNA2P26232 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNNA2P26232 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNNA2P26232 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNNA2P26232 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNNA2P26232 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNNA2P26232 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNNA2P26232 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNNA2P26232 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNNA2P26232 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNNA2P26232 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNNA2P26232 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNNA2P26232 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNNA2P26232 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNNA2P26232 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNNA2P26232 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNNA2P26232 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNNA2P26232 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNNA2P26232 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNNA2P26232 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNNA2P26232 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNNA2P26232 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms