Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
APCP25054 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
APCP25054 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
APCP25054 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
APCP25054 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
APCP25054 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
APCP25054 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
APCP25054 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
APCP25054 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
APCP25054 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
APCP25054 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
APCP25054 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
APCP25054 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
APCP25054 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
APCP25054 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
APCP25054 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
APCP25054 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
APCP25054 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
APCP25054 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
APCP25054 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
APCP25054 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
APCP25054 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
APCP25054 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
APCP25054 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
APCP25054 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
APCP25054 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
APCP25054 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
APCP25054 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
APCP25054 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
APCP25054 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
APCP25054 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
APCP25054 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
APCP25054 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
APCP25054 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
APCP25054 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
APCP25054 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
APCP25054 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
APCP25054 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
APCP25054 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
APCP25054 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
APCP25054 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
APCP25054 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
APCP25054 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
APCP25054 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
APCP25054 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
APCP25054 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
APCP25054 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
APCP25054 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
APCP25054 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
APCP25054 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
APCP25054 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
APCP25054 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
APCP25054 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
APCP25054 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
APCP25054 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
APCP25054 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
APCP25054 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
APCP25054 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
APCP25054 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
APCP25054 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
APCP25054 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
APCP25054 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
APCP25054 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
APCP25054 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
APCP25054 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
APCP25054 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
APCP25054 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
APCP25054 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
APCP25054 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
APCP25054 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
APCP25054 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
APCP25054 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
APCP25054 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
APCP25054 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
APCP25054 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
APCP25054 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
APCP25054 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APCP25054 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APCP25054 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APCP25054 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
APCP25054 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
APCP25054 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APCP25054 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APCP25054 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APCP25054 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APCP25054 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APCP25054 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
APCP25054 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APCP25054 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APCP25054 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
APCP25054 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
APCP25054 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
APCP25054 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APCP25054 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
APCP25054 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APCP25054 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APCP25054 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APCP25054 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
APCP25054 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APCP25054 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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