Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
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