Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYT1P21579 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYT1P21579 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYT1P21579 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYT1P21579 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYT1P21579 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYT1P21579 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYT1P21579 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYT1P21579 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYT1P21579 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYT1P21579 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYT1P21579 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYT1P21579 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SYT1P21579 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYT1P21579 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYT1P21579 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYT1P21579 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYT1P21579 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SYT1P21579 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYT1P21579 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYT1P21579 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYT1P21579 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYT1P21579 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYT1P21579 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYT1P21579 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYT1P21579 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYT1P21579 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SYT1P21579 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYT1P21579 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYT1P21579 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYT1P21579 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYT1P21579 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYT1P21579 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYT1P21579 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYT1P21579 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYT1P21579 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYT1P21579 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYT1P21579 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYT1P21579 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYT1P21579 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYT1P21579 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYT1P21579 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYT1P21579 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SYT1P21579 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYT1P21579 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYT1P21579 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYT1P21579 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYT1P21579 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYT1P21579 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYT1P21579 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYT1P21579 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYT1P21579 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYT1P21579 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYT1P21579 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYT1P21579 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYT1P21579 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYT1P21579 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYT1P21579 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYT1P21579 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYT1P21579 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYT1P21579 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYT1P21579 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SYT1P21579 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYT1P21579 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYT1P21579 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYT1P21579 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYT1P21579 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYT1P21579 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYT1P21579 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYT1P21579 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYT1P21579 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYT1P21579 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SYT1P21579 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYT1P21579 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYT1P21579 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYT1P21579 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYT1P21579 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYT1P21579 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYT1P21579 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYT1P21579 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYT1P21579 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYT1P21579 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYT1P21579 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYT1P21579 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYT1P21579 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYT1P21579 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYT1P21579 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYT1P21579 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SYT1P21579 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SYT1P21579 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYT1P21579 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYT1P21579 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYT1P21579 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYT1P21579 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYT1P21579 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYT1P21579 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYT1P21579 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SYT1P21579 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SYT1P21579 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYT1P21579 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms