Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms