Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
XBP1P17861 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
XBP1P17861 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
XBP1P17861 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
XBP1P17861 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
XBP1P17861 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
XBP1P17861 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
XBP1P17861 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
XBP1P17861 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
XBP1P17861 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
XBP1P17861 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
XBP1P17861 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
XBP1P17861 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
XBP1P17861 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
XBP1P17861 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
XBP1P17861 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
XBP1P17861 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
XBP1P17861 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
XBP1P17861 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
XBP1P17861 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
XBP1P17861 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
XBP1P17861 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
XBP1P17861 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
XBP1P17861 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
XBP1P17861 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
XBP1P17861 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
XBP1P17861 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
XBP1P17861 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
XBP1P17861 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
XBP1P17861 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
XBP1P17861 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
XBP1P17861 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
XBP1P17861 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
XBP1P17861 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
XBP1P17861 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
XBP1P17861 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
XBP1P17861 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
XBP1P17861 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
XBP1P17861 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
XBP1P17861 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
XBP1P17861 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
XBP1P17861 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
XBP1P17861 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
XBP1P17861 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
XBP1P17861 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
XBP1P17861 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
XBP1P17861 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
XBP1P17861 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
XBP1P17861 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
XBP1P17861 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
XBP1P17861 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
XBP1P17861 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
XBP1P17861 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
XBP1P17861 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
XBP1P17861 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
XBP1P17861 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
XBP1P17861 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
XBP1P17861 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
XBP1P17861 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
XBP1P17861 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
XBP1P17861 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
XBP1P17861 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
XBP1P17861 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
XBP1P17861 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
XBP1P17861 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
XBP1P17861 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
XBP1P17861 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
XBP1P17861 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
XBP1P17861 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
XBP1P17861 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
XBP1P17861 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
XBP1P17861 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
XBP1P17861 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
XBP1P17861 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
XBP1P17861 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
XBP1P17861 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
XBP1P17861 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
XBP1P17861 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
XBP1P17861 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
XBP1P17861 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
XBP1P17861 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
XBP1P17861 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
XBP1P17861 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
XBP1P17861 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
XBP1P17861 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
XBP1P17861 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
XBP1P17861 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
XBP1P17861 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
XBP1P17861 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
XBP1P17861 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
XBP1P17861 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
XBP1P17861 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
XBP1P17861 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
XBP1P17861 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
XBP1P17861 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
XBP1P17861 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
XBP1P17861 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
XBP1P17861 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
XBP1P17861 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
XBP1P17861 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms