Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms