Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms