Protein–RNA interactions for Protein: P08174

CD55, Complement decay-accelerating factor, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD55P08174 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD55P08174 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD55P08174 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD55P08174 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD55P08174 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD55P08174 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD55P08174 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD55P08174 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD55P08174 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD55P08174 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD55P08174 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD55P08174 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD55P08174 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD55P08174 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD55P08174 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD55P08174 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD55P08174 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CD55P08174 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD55P08174 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD55P08174 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD55P08174 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CD55P08174 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD55P08174 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD55P08174 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD55P08174 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD55P08174 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD55P08174 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD55P08174 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD55P08174 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD55P08174 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD55P08174 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD55P08174 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD55P08174 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD55P08174 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD55P08174 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD55P08174 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD55P08174 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD55P08174 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD55P08174 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD55P08174 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD55P08174 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD55P08174 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CD55P08174 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD55P08174 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD55P08174 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CD55P08174 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD55P08174 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD55P08174 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD55P08174 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD55P08174 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD55P08174 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD55P08174 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD55P08174 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD55P08174 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CD55P08174 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD55P08174 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CD55P08174 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CD55P08174 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CD55P08174 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CD55P08174 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CD55P08174 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CD55P08174 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD55P08174 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CD55P08174 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CD55P08174 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CD55P08174 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CD55P08174 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CD55P08174 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CD55P08174 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CD55P08174 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CD55P08174 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD55P08174 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD55P08174 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CD55P08174 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CD55P08174 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CD55P08174 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD55P08174 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CD55P08174 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD55P08174 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CD55P08174 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD55P08174 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CD55P08174 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD55P08174 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD55P08174 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CD55P08174 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD55P08174 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD55P08174 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CD55P08174 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD55P08174 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CD55P08174 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CD55P08174 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD55P08174 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD55P08174 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD55P08174 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD55P08174 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CD55P08174 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD55P08174 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD55P08174 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD55P08174 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD55P08174 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms