Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NGFRP08138 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NGFRP08138 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NGFRP08138 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NGFRP08138 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NGFRP08138 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NGFRP08138 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NGFRP08138 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NGFRP08138 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NGFRP08138 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NGFRP08138 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NGFRP08138 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NGFRP08138 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NGFRP08138 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NGFRP08138 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NGFRP08138 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NGFRP08138 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NGFRP08138 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NGFRP08138 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NGFRP08138 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NGFRP08138 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NGFRP08138 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NGFRP08138 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NGFRP08138 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NGFRP08138 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NGFRP08138 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NGFRP08138 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NGFRP08138 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NGFRP08138 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NGFRP08138 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NGFRP08138 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NGFRP08138 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NGFRP08138 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NGFRP08138 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NGFRP08138 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NGFRP08138 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NGFRP08138 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NGFRP08138 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NGFRP08138 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NGFRP08138 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NGFRP08138 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NGFRP08138 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NGFRP08138 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NGFRP08138 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NGFRP08138 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NGFRP08138 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NGFRP08138 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NGFRP08138 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NGFRP08138 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NGFRP08138 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NGFRP08138 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NGFRP08138 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NGFRP08138 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NGFRP08138 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NGFRP08138 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NGFRP08138 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NGFRP08138 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NGFRP08138 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NGFRP08138 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NGFRP08138 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NGFRP08138 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NGFRP08138 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NGFRP08138 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NGFRP08138 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NGFRP08138 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NGFRP08138 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NGFRP08138 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NGFRP08138 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NGFRP08138 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NGFRP08138 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NGFRP08138 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NGFRP08138 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NGFRP08138 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NGFRP08138 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NGFRP08138 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NGFRP08138 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NGFRP08138 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NGFRP08138 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NGFRP08138 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NGFRP08138 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NGFRP08138 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NGFRP08138 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NGFRP08138 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NGFRP08138 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NGFRP08138 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NGFRP08138 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NGFRP08138 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NGFRP08138 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NGFRP08138 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NGFRP08138 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NGFRP08138 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NGFRP08138 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NGFRP08138 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NGFRP08138 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NGFRP08138 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NGFRP08138 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NGFRP08138 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NGFRP08138 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NGFRP08138 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NGFRP08138 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms