Protein–RNA interactions for Protein: P04259

KRT6B, Keratin, type II cytoskeletal 6B, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6BP04259 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT6BP04259 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms