Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms