Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLR1AO95602 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLR1AO95602 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLR1AO95602 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLR1AO95602 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLR1AO95602 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLR1AO95602 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLR1AO95602 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLR1AO95602 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLR1AO95602 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLR1AO95602 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
POLR1AO95602 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLR1AO95602 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLR1AO95602 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR1AO95602 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR1AO95602 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR1AO95602 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR1AO95602 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR1AO95602 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR1AO95602 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR1AO95602 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR1AO95602 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR1AO95602 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR1AO95602 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR1AO95602 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR1AO95602 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR1AO95602 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR1AO95602 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR1AO95602 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR1AO95602 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR1AO95602 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR1AO95602 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR1AO95602 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR1AO95602 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR1AO95602 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR1AO95602 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
POLR1AO95602 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
POLR1AO95602 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC25.51■■□□□ 1.68
POLR1AO95602 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC25.51■■□□□ 1.68
POLR1AO95602 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC25.51■■□□□ 1.68
POLR1AO95602 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC25.51■■□□□ 1.68
POLR1AO95602 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
POLR1AO95602 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
POLR1AO95602 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms