Protein–RNA interactions for Protein: O95428

PAPLN, Papilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPLNO95428 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAPLNO95428 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PAPLNO95428 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAPLNO95428 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAPLNO95428 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAPLNO95428 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAPLNO95428 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAPLNO95428 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAPLNO95428 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAPLNO95428 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAPLNO95428 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAPLNO95428 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAPLNO95428 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAPLNO95428 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PAPLNO95428 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAPLNO95428 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAPLNO95428 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAPLNO95428 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PAPLNO95428 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAPLNO95428 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAPLNO95428 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAPLNO95428 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAPLNO95428 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAPLNO95428 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAPLNO95428 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAPLNO95428 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAPLNO95428 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PAPLNO95428 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
PAPLNO95428 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAPLNO95428 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAPLNO95428 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAPLNO95428 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAPLNO95428 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAPLNO95428 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAPLNO95428 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAPLNO95428 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAPLNO95428 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAPLNO95428 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAPLNO95428 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAPLNO95428 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAPLNO95428 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAPLNO95428 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAPLNO95428 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAPLNO95428 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAPLNO95428 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAPLNO95428 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAPLNO95428 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAPLNO95428 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PAPLNO95428 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAPLNO95428 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAPLNO95428 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAPLNO95428 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PAPLNO95428 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAPLNO95428 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PAPLNO95428 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAPLNO95428 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAPLNO95428 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAPLNO95428 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAPLNO95428 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAPLNO95428 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAPLNO95428 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PAPLNO95428 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PAPLNO95428 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAPLNO95428 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAPLNO95428 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAPLNO95428 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAPLNO95428 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAPLNO95428 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAPLNO95428 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAPLNO95428 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAPLNO95428 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAPLNO95428 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAPLNO95428 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAPLNO95428 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAPLNO95428 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAPLNO95428 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAPLNO95428 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAPLNO95428 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAPLNO95428 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAPLNO95428 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAPLNO95428 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAPLNO95428 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAPLNO95428 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAPLNO95428 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAPLNO95428 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAPLNO95428 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAPLNO95428 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAPLNO95428 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAPLNO95428 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAPLNO95428 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAPLNO95428 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAPLNO95428 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAPLNO95428 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAPLNO95428 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAPLNO95428 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAPLNO95428 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAPLNO95428 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAPLNO95428 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAPLNO95428 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAPLNO95428 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms